北京2019年7月15日 /美通社/ -- 近期,上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院(以下簡稱“瑞金醫(yī)院”)與中科曙光達成合作,未來將建設一套符合國際標準、具備技術先進性的“臨床資源深度分析和挖掘測序模塊計算平臺”(以下簡稱“計算平臺”),通過提升醫(yī)療數(shù)據(jù)檢索、統(tǒng)計分析、圖形化呈現(xiàn)在內的大規(guī)模數(shù)據(jù)挖掘能力,支持“轉化醫(yī)學”的醫(yī)療、科研人員進行總結和探索性的科研工作,讓寫在紙上的論文盡快變成用于臨床的新治療方法,聯(lián)手攻關危害人類健康的重大疾病。
IT與生物信息融合,解碼“生命信息”
在大數(shù)據(jù)、人工智能和高性能計算逐漸融合的趨勢下,設計與實現(xiàn)高性能的數(shù)據(jù)解讀學習模型、算法與軟件,是逾越生命信息學“數(shù)據(jù)鴻溝”的主要手段。
本次“臨床資源深度分析和挖掘測序模塊計算平臺”的建設將以患者生理生化指標,器官影像檢查、家族遺傳背景等多維度的數(shù)據(jù)為基礎,結合基因組測序、蛋白質組學和代謝組學等各種先進組學檢測等技術,通過生物信息學手段進行綜合數(shù)據(jù)分析和挖掘,提供與疾病診斷和治療相關的遺傳和臨床信息。形成特征數(shù)據(jù)后,再通過機器深度學習和人工智能等方法,實現(xiàn)真正意義上的精準分析、輔助診斷和個性化醫(yī)療。
海量生物數(shù)據(jù)解讀,逾越“數(shù)據(jù)鴻溝”
基因組測序、蛋白質組學、代謝組學等先進組學檢測等技術在生命科學研究和人類健康領域的應用是將生物信息轉化為數(shù)字信息,這些數(shù)據(jù)來自于大量的生物樣本、科研中間數(shù)據(jù)和實驗結果,這些數(shù)字信息如同金礦一樣,等待被挖掘出不可估量的價值。
中科曙光憑借多年在生物基因領域積累的經(jīng)驗,打造生物基因行業(yè)云存儲解決方案。通過Scale-Out橫向擴展、IB+RDMA高速互聯(lián)、內核態(tài)POSIX協(xié)議、智能SSD Cache及小文件聚合等技術,消除傳統(tǒng)的Scale-up縱向擴展存儲架構的性能局限性,解決生物基因應用中對海量大文件存儲場景高聚合帶寬、小文件存儲場景高IOPS的存儲需求。
其次,基因研究產(chǎn)生的數(shù)據(jù)正以每12-18個月10倍的速度快速增長,曙光ParaStor分布式存儲系統(tǒng)可通過性能與容量的線性增長,滿足存儲系統(tǒng)對數(shù)據(jù)處理能力和擴展性的要求,并通過多種技術手段,從物理底層到邏輯層全方位保證存儲系統(tǒng)高可靠性和高可用性,滿足前端多種基因測序軟件、多種業(yè)務應用的存儲對接需求。
未來,曙光生物基因行業(yè)云存儲解決方案將廣泛運用于生命科學領域,為廣大客戶的業(yè)務提供有效的性能保障和技術支持。