北京2024年6月25日 /美通社/ -- 我國(guó)“腦科學(xué)與類腦科學(xué)研究”及國(guó)際相關(guān)領(lǐng)域均將阿爾茨海默病列為重點(diǎn)研究和探索的病種,并在藥物研發(fā)和社會(huì)支持上加大力度。阿爾茨海默病是一種中樞神經(jīng)系統(tǒng)的退行性病變,也是導(dǎo)致老年人認(rèn)知功能下降的主要原因。其研究涉及大量的臨床數(shù)據(jù),需要構(gòu)建數(shù)學(xué)模型來(lái)模擬疾病的發(fā)展過(guò)程,預(yù)測(cè)疾病的進(jìn)展,以及評(píng)估不同干預(yù)措施的效果,這需要強(qiáng)大的計(jì)算基礎(chǔ)設(shè)施來(lái)支持其復(fù)雜的數(shù)據(jù)處理和分析任務(wù)。
為此,首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院(以下簡(jiǎn)稱“宣武醫(yī)院”)與浪潮信息共同探討并建設(shè)了腦研究科研計(jì)算平臺(tái)。通過(guò)建設(shè)高質(zhì)量算力基礎(chǔ)設(shè)施,實(shí)現(xiàn)對(duì)醫(yī)學(xué)影像、基因、病理等多模態(tài)數(shù)據(jù)的快速分析,為臨床診斷和治療提供更為精確的依據(jù)。
構(gòu)筑高效科研平臺(tái) 挑戰(zhàn)國(guó)內(nèi)腦研究制高點(diǎn)
腦科學(xué)與類腦研究是“十四五”規(guī)劃《綱要》指明的重要研究方向,宣武醫(yī)院作為國(guó)家神經(jīng)疾病醫(yī)學(xué)中心、中國(guó)國(guó)際神經(jīng)科學(xué)研究所及國(guó)家老年疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心的重要載體,正站在國(guó)內(nèi)外行業(yè)的前沿,不斷探索與突破。為加速腦科學(xué)研究,宣武醫(yī)院已經(jīng)構(gòu)建起國(guó)內(nèi)頂尖的腦研究科研平臺(tái),該平臺(tái)需要對(duì)影像、基因、病理等海量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析深度分析和高效處理,進(jìn)而得到最準(zhǔn)確的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。一期規(guī)劃涉及4000余例病例數(shù)據(jù),后期預(yù)計(jì)擴(kuò)展至萬(wàn)例以上。綜合數(shù)據(jù)、影像數(shù)據(jù)、基因數(shù)據(jù)、電生理、樣本庫(kù)等各項(xiàng)數(shù)據(jù)不斷積累,未來(lái)預(yù)計(jì)將達(dá)到PB級(jí)。如此龐大的數(shù)據(jù)需要進(jìn)行快速處理,對(duì)醫(yī)院科研平臺(tái)的計(jì)算力和存儲(chǔ)力提出了嚴(yán)峻挑戰(zhàn)。
首先,為滿足科研計(jì)算的密集需求,宣武醫(yī)院需要構(gòu)建一個(gè)高效能科研算力平臺(tái),確保多個(gè)節(jié)點(diǎn)能協(xié)同作業(yè),應(yīng)對(duì)海量數(shù)據(jù)計(jì)算的挑戰(zhàn),算力平臺(tái)不僅要具備高性能,還要保證極高的穩(wěn)定性和擴(kuò)展性。其次科研計(jì)算過(guò)程中會(huì)依托大量的中間數(shù)據(jù),如行為學(xué)數(shù)據(jù)、腦電圖及功能磁共振成像、光學(xué)成像、電子顯微鏡成像、神經(jīng)元電活動(dòng)、神經(jīng)元基因測(cè)序數(shù)據(jù)等,這些數(shù)據(jù)需要進(jìn)行頻繁的交互和優(yōu)化,因此一個(gè)高效的數(shù)據(jù)交互和存儲(chǔ)系統(tǒng)尤為重要。
此外,靈活性和可管理性也是科研平臺(tái)不可忽視的需求。由于該系統(tǒng)需要支撐神經(jīng)內(nèi)科、神經(jīng)外科、神經(jīng)放射科等腦科室的共同使用,宣武醫(yī)院需要通過(guò)任務(wù)調(diào)度系統(tǒng)、虛擬化技術(shù)、異構(gòu)計(jì)算資源整合以及存儲(chǔ)分級(jí)等手段,為醫(yī)院科研平臺(tái)提供統(tǒng)一、靈活且可快速重構(gòu)的資源管理解決方案,包括裸機(jī)、虛擬機(jī)、容器化、虛擬防火墻、負(fù)載均衡、存儲(chǔ)、數(shù)據(jù)庫(kù)等多種服務(wù),確保腦科學(xué)研究平臺(tái)系統(tǒng)資源的高效分配。
計(jì)算賦能醫(yī)學(xué) 拓展腦科學(xué)研究邊界
在深入了解客戶信息化現(xiàn)狀和需求后,浪潮信息為宣武醫(yī)院打造高效科研系統(tǒng)平臺(tái),一期IT基礎(chǔ)設(shè)施包括了9臺(tái)計(jì)算型節(jié)點(diǎn)、5臺(tái)存儲(chǔ)型節(jié)點(diǎn),3臺(tái)資源管理節(jié)點(diǎn),2臺(tái)網(wǎng)絡(luò)管理節(jié)點(diǎn)以支撐諸如影像數(shù)據(jù)管理、基因數(shù)據(jù)管理、電生理和樣本庫(kù)等各類應(yīng)用。一期配置計(jì)算資源的總量包含700+算力核心、存儲(chǔ)資源總量約180+TB,同時(shí)建立備份系統(tǒng),提供100+TB備份容量。充分保證系統(tǒng)的高性能和靈活性的同時(shí),還必須保證系統(tǒng)的可靠和數(shù)據(jù)的安全。
計(jì)算更高效:算力節(jié)點(diǎn)采用浪潮信息的四路服務(wù)器,具備卓越的計(jì)算性能,能夠滿足醫(yī)院科研數(shù)據(jù)搬移、在線計(jì)算等任務(wù)的高帶寬和低時(shí)延需求。同時(shí)該平臺(tái)擁有更強(qiáng)的I/O擴(kuò)展能力,支持業(yè)務(wù)平滑升級(jí),減少服務(wù)器因突發(fā)流量或負(fù)載增加而導(dǎo)致的系統(tǒng)崩潰或性能下降的風(fēng)險(xiǎn),提供計(jì)算能力更強(qiáng)、擴(kuò)展更靈活的解決方案。
存儲(chǔ)更可靠:存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn)采用分布式架構(gòu),同時(shí)實(shí)現(xiàn)存儲(chǔ)資源池化,提供塊、文件、對(duì)象和大數(shù)據(jù)服務(wù)。單一存儲(chǔ)系統(tǒng)支持?jǐn)?shù)據(jù)中心,確保業(yè)務(wù)穩(wěn)定、數(shù)據(jù)處理高效、成本優(yōu)化。
管理更便捷:部署管理平臺(tái)對(duì)資源池進(jìn)行統(tǒng)一調(diào)度,通過(guò)虛擬化技術(shù)實(shí)現(xiàn)資源池化。融合服務(wù)流程、認(rèn)證審批、應(yīng)用交付、生命周期管理、業(yè)務(wù)中間件、安全防護(hù)、服務(wù)水平管理等自動(dòng)化運(yùn)維手段,為宣武醫(yī)院科研平臺(tái)提供安全便捷的IT服務(wù)應(yīng)用。
基于浪潮信息計(jì)算解決方案,宣武醫(yī)院腦研究科研計(jì)算平臺(tái)一期項(xiàng)目實(shí)現(xiàn)了4000+病例數(shù)據(jù)的高速分析,工作效率提升30%以上。該平臺(tái)的智能化為宣武醫(yī)院開(kāi)展各類各類阿爾茨海默病的篩查、診斷和治療研究提供了極大便利。未來(lái),宣武醫(yī)院將繼續(xù)基于腦研究科研計(jì)算平臺(tái),加速高水平腦疾病診療技術(shù)的研發(fā)和應(yīng)用,為全球腦健康研究貢獻(xiàn)重要成果。