深圳2022年4月29日 /美通社/ -- 2021年底，承啟生物首席科學(xué)家、暨南大學(xué)張弓教授當(dāng)選國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃執(zhí)行委員會常務(wù)委員，這是目前在這一國際大型合作項(xiàng)目中，中國人任職的最高職位。與此同時(shí)，張弓教授還被任命領(lǐng)導(dǎo)8號染色體編碼蛋白質(zhì)的研究，加上此前暨南大學(xué)何慶瑜教授已被任命領(lǐng)導(dǎo)20號染色體編碼蛋白質(zhì)的研究，至此，暨南大學(xué)承擔(dān)了中國大陸三分之二的蛋白質(zhì)研究任務(wù)，成為中國人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的最大承擔(dān)單位。
國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃執(zhí)行委員會常務(wù)委員、承啟生物首席科學(xué)家、暨南大學(xué)教授張弓
以多項(xiàng)領(lǐng)先科研成果 在全球?qū)W術(shù)舞臺上發(fā)出"中國聲音"
蛋白質(zhì)是組成人體一切細(xì)胞、組織的必要成分，是生命活動的實(shí)際承擔(dān)者。在人類基因組計(jì)劃完成后，人類基因組各基因及其功能都有待在蛋白質(zhì)層面予以揭示和闡明。事實(shí)上，蛋白質(zhì)組比基因組復(fù)雜得多。據(jù)專家估計(jì)，人類基因組上約2萬個(gè)基因可變化出高達(dá)數(shù)百萬種蛋白質(zhì)形體(Proteoforms)，因此系統(tǒng)性研究人類蛋白質(zhì)組勢在必行。為此，國際上成立了人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃（Human Proteome Project, HPP），這是人類基因組計(jì)劃之后的又一大型國際科學(xué)合作項(xiàng)目。2012年，"染色體中心的人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃（CHPP）"作為HPP的核心正式啟動，其主要目的是鑒定所有人類蛋白質(zhì)，迄今為止仍在進(jìn)行中。
此次，張弓教授被任命為國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃執(zhí)行委員會常務(wù)委員，表明中國關(guān)于人類蛋白質(zhì)的研究已躋身世界前列，并獲得國際學(xué)術(shù)界的高度認(rèn)可，徹底掌握該領(lǐng)域的核心話語權(quán)。
事實(shí)上，此次張弓教授的當(dāng)選絕非偶然，自2013年開始，張弓教授就和其他中國科學(xué)家一起，在人類蛋白質(zhì)研究領(lǐng)域中不斷發(fā)出中國聲音。
HUPO2014大會上，張弓教授與國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的發(fā)起人Young-Ki Paik（韓國延世大學(xué)教授）在完成翻譯組學(xué)的特邀報(bào)告后合影
2013年，張弓教授團(tuán)隊(duì)研發(fā)成功翻譯組測序技術(shù)，并與王通教授、何慶瑜教授研究組一同提出，翻譯組測序可以為蛋白質(zhì)組質(zhì)譜解析提供獨(dú)立而精密的參考信息，從而極大提高解析蛋白質(zhì)組的能力。該技術(shù)于2014年被作為CHPP的核心支柱之一，并在同年被人類蛋白質(zhì)組組織列為國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的首要突出貢獻(xiàn)；
2018年，張弓教授等人在核心生物期刊Nucleic Acids Research（《核酸研究》）上發(fā)表了目前最全的翻譯組學(xué)數(shù)據(jù)庫TranslatomeDB，該數(shù)據(jù)為蛋白質(zhì)組研究提供了重要的參照資源和獨(dú)立質(zhì)控?cái)?shù)據(jù)源；
2019年，張弓教授、王通教授、何慶瑜教授研究組通過翻譯組測序和蛋白質(zhì)組質(zhì)譜技術(shù)，發(fā)現(xiàn)了數(shù)千個(gè)此前被認(rèn)為的"非編碼RNA"實(shí)際上可翻譯出蛋白質(zhì)。該研究系統(tǒng)性地重新注釋了人類基因組，打開了一個(gè)全新的人類"暗蛋白質(zhì)組"世界，也為研究各種重大疾病的機(jī)制、研發(fā)新型診斷和治療方法探索出了更多可能。
翻譯組(RNC-mRNA)被作為國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的核心支柱之一。Reprinted with permission from J. Proteome Res. 2014, 13, 1, 50–59. Copyright 2014 American Chemical Society.
由于其突出貢獻(xiàn)，張弓教授被推選為2022-2024年CHPP新一屆執(zhí)行委員會常委。此次張弓教授在國際舞臺上榮膺國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃執(zhí)行委員會常務(wù)委員，亦是對其在過去10年不斷在翻譯組測序技術(shù)和蛋白質(zhì)組質(zhì)譜技術(shù)相關(guān)領(lǐng)域的肯定。未來，在以張弓教授為首的中國科學(xué)家?guī)ьI(lǐng)下，中國的人類蛋白質(zhì)研究還將取得更多新突破，為解密人體的"健康密碼"貢獻(xiàn)更多力量。
以技術(shù)創(chuàng)新破局 促推行業(yè)發(fā)展
在學(xué)術(shù)研究者的身份之外，張弓教授的另一個(gè)身份是承啟生物的聯(lián)合創(chuàng)始人，在其帶領(lǐng)下，承啟生物也不斷為國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃貢獻(xiàn)企業(yè)力量。
作為一家致力于用基因科技為人們提供精準(zhǔn)醫(yī)療及健康管理服務(wù)的科技公司，承啟生物建立了極為豐富的翻譯組學(xué)研究，是目前僅少數(shù)能提供多物種翻譯組測序及分析，并掌握著一系列翻譯組測序技術(shù)專利的公司，得益于此，2017年，承啟生物宣布為國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃免費(fèi)提供翻譯組測序服務(wù)，助力國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃早日完成。
張弓教授受邀在HUPO2017大會上作關(guān)于發(fā)現(xiàn)人類“暗蛋白質(zhì)組”的專題報(bào)告，并在會上宣布承啟生物將為國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃免費(fèi)提供翻譯組測序服務(wù)
自2022年起，國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的官方數(shù)據(jù)庫neXtProt的亞洲分站也由承啟生物建設(shè)、運(yùn)營和維護(hù)。這是國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃第一次將官方數(shù)據(jù)庫交由亞洲公司運(yùn)維，需要團(tuán)隊(duì)具備海量組學(xué)數(shù)據(jù)的精準(zhǔn)處理能力和超大型生物信息數(shù)據(jù)庫的運(yùn)維能力。最終，選由承啟生物作為該數(shù)據(jù)庫的承接者，對于中國在國際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃中核心地位的提升具有重大意義。4月，位于瑞士的neXtProt數(shù)據(jù)庫團(tuán)隊(duì)開始向承啟生物同步現(xiàn)有數(shù)據(jù)。
如果說，張弓教授是承啟生物的主心骨，那么其原創(chuàng)的"中國造"FANSe算法就是承接HPP官方數(shù)據(jù)庫建立的基石。FANSe系列核酸測序算法是迄今為止穩(wěn)健性和準(zhǔn)確性最高的比對算法，同時(shí)具備很高的容錯(cuò)性，被CHPP指定為核心支柱的推薦算法，可單機(jī)5分鐘分析完一個(gè)人全基因組測序數(shù)據(jù)集，刷新世界紀(jì)錄。FANSe算法另一個(gè)特性是全自主開發(fā)，這使得其可移植性和擴(kuò)展性幾乎沒有任何限制，可高效運(yùn)行于全國產(chǎn)的計(jì)算機(jī)上，在目前國際貿(mào)易爭端形勢嚴(yán)峻的情況下，無論在軟件還是硬件層面，使用FANSe算法都不會被國外卡脖子。以FANSe算法為基礎(chǔ)，張弓教授團(tuán)隊(duì)和承啟生物陸續(xù)成功研發(fā)了一系列高精度算法和實(shí)驗(yàn)方案，橫跨核酸測序、蛋白質(zhì)組、代謝組等，建立了完整的國產(chǎn)化全組學(xué)高性能、高精度分析體系，確保了中國精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的精準(zhǔn)與安全。
未來，承啟生物將繼續(xù)依托自身的技術(shù)優(yōu)勢和資源，將更多更創(chuàng)新的基因測序、翻譯組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等技術(shù)應(yīng)用于臨床與科研，為全面解析人類蛋白質(zhì)組貢獻(xiàn)一己之力，推動"以蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)"的發(fā)展。
