英格蘭牛津2020年2月3日 /美通社/ -- 在獲得中國公共健康專業(yè)人員的廣泛支持并與他們進(jìn)行合作之后,Oxford Nanopore已經(jīng)向中國發(fā)運(yùn)了另外200臺MinION測序儀以及相關(guān)耗材。這些器械將被用于對現(xiàn)在的冠狀病毒爆發(fā)進(jìn)行持續(xù)監(jiān)測,為已經(jīng)在中國安裝的設(shè)備帶來大批支援力量。
Oxford Nanopore已經(jīng)為100多個中國公共衛(wèi)生實驗室,以及一系列中國微生物學(xué)實驗室和全球公共衛(wèi)生科學(xué)家提供支持,越來越多的科學(xué)家開始參與監(jiān)測過程。
Oxford Nanopore首席執(zhí)行官戈登-桑赫拉(Gordon Sanghera)博士表示:“我們很榮幸能夠與全球科學(xué)界合作,支持他們了解此次疫情爆發(fā)的問題。我們希望支持任何人能夠在任何地方獲取生物信息的納米孔愿景,能夠產(chǎn)生積極的影響,并且非常感謝科學(xué)界在我們努力為此次疫情爆發(fā)迅速優(yōu)化時,給予我們支持。”
MinION測序儀被設(shè)計用來進(jìn)行廣泛使用。這款測序儀重量不超過100克,搭配便攜式/特別配件MinIT,以便進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。MinION測序儀能夠?qū)崟r簡化序列數(shù)據(jù),支持進(jìn)行快速測序,非常適合在分散開來的地點開展快速測序工作。之前,這款設(shè)備已經(jīng)在鄉(xiāng)村/偏遠(yuǎn)地區(qū)背景下,進(jìn)行過測序,例如支持對埃博拉病毒、寨卡病毒或結(jié)核桿菌的了解。
伯明翰大學(xué)(University of Birmingham)的喬什-奎克(Josh Quick)于2016年在《自然》(Nature)雜志上表示:“我們能夠在獲得埃博拉病毒陽性樣本24小時以內(nèi)取得結(jié)果,測序過程僅需15分鐘至60分鐘。我們能夠證明,在資源有限的背景下,進(jìn)行實時基因組監(jiān)測是可行的,這樣的監(jiān)測能夠迅速展開,支持監(jiān)測疫情?!?/i>(請參閱:https://www.nature.com/articles/nature16996 )
冠狀病毒的快速排序,一直都是了解疫情爆發(fā)問題上面的一項必要工具。序列信息一般能夠?qū)⒌攸c和時間數(shù)據(jù)結(jié)合到一起,就病毒如何傳播和是否發(fā)生變異,進(jìn)行洞察分析。
Oxford Nanopore的測序技術(shù),已經(jīng)被用于來自于中國的眾多早期冠狀病毒基因組的測序,包括在《新英格蘭醫(yī)學(xué)期刊》(NEJM)上公布的首個基因組,在《柳葉刀》(Lancet)雜志上發(fā)布的表明人際間傳播的家族“聚集性”肺炎的基因組,以及美國發(fā)布的首個新型冠狀病毒基因組。
科學(xué)界的研究者已經(jīng)為新型冠狀病毒(nCoV)的納米孔測序,開發(fā)了專門方案;Oxford Nanopore正在與科學(xué)界一起對這些方案進(jìn)行優(yōu)化。
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